实验室分子蒸馏是一种在高真空下运行的蒸馏方法。此时，蒸汽分子的平均自由度大于蒸发表面与冷凝表面之间的距离，因此液体混合物可以通过材料和液体中各组分蒸发率的差异来分离。

在一定温度下，压力越低，气体分子的平均自由度就越大。当蒸发空间的压力很低(10~10mmHg)，当冷凝表面靠近蒸发表面时，垂直距离小于气体分子的平均自由度时，蒸发表面蒸发的蒸汽分子不能与其他分子碰撞，直接到达冷凝表面。

实验室分子蒸馏是一种特殊的液液分离技术，它不同于传统的蒸馏分离原理，而是通过不同物质分子运动平均自由度的差异来实现分离。

当液体混合物沿加热板流动并加热时，重分子会从液体表面逸出并进入气相。由于重分子的轻度和自由度不同，不同物质的分子从液体表面逸出后有不同的移动距离。如果能适当设置冷凝板，轻分子会达到冷凝板被冷凝排出，而重分子不会达到冷凝板沿混合液排出的目的。

这样就可以达到物质分离的目的。沸腾膜与冷凝面之间的压差是蒸汽流向的驱动力，微小的压降会导致蒸汽流动。

在1mbar基于这一原理的蒸馏器称为短程蒸馏器。短程蒸馏器（分子蒸馏器）在加热面对面有一个内置的冷凝器，并将操作压力降低到0.001mbar。

短程蒸馏器是一种工作~0.001mbar压力下热分离技术工艺，沸腾温度低，非常适合热敏性、高沸点物。

其基本组成：带加热夹套的圆柱形气缸、转子和内置冷凝器；转子固定架上精确安装刮刀和防飞溅装置。内置冷凝器位于蒸发器的中心，转子在圆柱形气缸和冷凝器之间旋转。

短程蒸馏器由外加热的垂直圆筒、位于其中心的冷凝器和在蒸馏器和冷凝器之间旋转的刮膜器组成。

蒸馏过程是：物料从蒸发器顶部加入，通过转子上的液体分布器连续均匀地分布在加热表面，然后刮刀将液体刮成非常薄、湍流的液体膜，螺旋向下推。

在此过程中，从加热表面逸出的轻分子通过短路线和几乎没有碰撞的内置冷凝器冷凝成液体，沿冷凝器管流下，通过蒸发器底部的出料管排出；残留液体是重分子在加热区下的圆形通道中收集，然后通过侧出料管流出。

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